Οι Πρέσπες αποτελούν μια ορεινή λιμναία περιοχή εξαιρετικής φυσικής ομορφιάς, στα βορειοδυτικά σύνορα της Ελλάδας με την Αλβανία και τη Βόρεια Μακεδονία, σε υψόμετρο 857 μέτρων για τη Μικρή Πρέσπα και περίπου 852 μέτρων για τη Μεγάλη Πρέσπα. Οι δύο λίμνες που διακρίνονται είναι η Μεγάλη Πρέσπα, η οποία ανήκει στην Ελλάδα, τη Βόρεια Μακεδονία και την Αλβανία, και η Μικρή Πρέσπα, η οποία καταλαμβάνει κυρίως ελληνικό έδαφος (περίπου 43,5 τ.χλμ.), ενώ ένα μικρότερο τμήμα στα δυτικά ανήκει στην Αλβανία (λιγότερο από 4 τ.χλμ.). Λόγω της πτώσης της στάθμης των υδάτων στη Μικρή Πρέσπα, το τμήμα που ανήκει στην Αλβανία έχει σχεδόν εξαφανιστεί.

Τα παραδοσιακά χωριά των λιμνών περιβάλλονται από ορεινούς όγκους, όπως ο Βαρνούντας στα ανατολικά και το Τρικλάρι (Βαρνούντας) στα νότια. Η Μεγάλη Πρέσπα, περιβαλλόμενη από εντυπωσιακούς ορεινούς σχηματισμούς, επικοινωνεί υπόγεια με τη λίμνη Οχρίδα και η στάθμη των υδάτων των δύο λιμνών παρουσιάζει κατά περιόδους μεταβολές.